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Cartographie de la littérature autour des propriétés antivirales

Ces cartes ont été réalisées en utilisant le logiciel libre Gargantext à partir d'un corpus PubMed de 16k articles extraits le 5 avril 2020 avec la requête suivante:
"antiviral".

La méthodologie est décrite ici

Lorsque vous cliquez sur un terme, les termes les plus liés sont affichés dans un tags cloud sur la droite avec les publications de PubMed qui mentionnent le plus les termes sélectionnés (jusqu'au 5 avril 2020).

Dans les cartes distributionnelles (la première carte à être chargée), les liens entre les termes utilisent une mesure de proximité qui prend en compte les profils d'interaction de chaque terme avec les autres. Elle peut déduire des relations pertinentes entre les termes même si ceux-ci ne sont pas co-mentionnés dans un même article (mesure de proximité de second ordre).

Dans la carte conditionnelle, les liens entre les termes représentent la probabilité conditionnelle qu'un terme soit co-présent dans un article étant donné un autre (c'est la mesure de "confidence").

Dans chaque graphique, la taille du nœud est fonction du pagerank du terme dans le graphique.

La formule mathématique de ces mesures de proximité se trouve dans la Documentation Gargantext.

Téléchargez tous les corpus et la liste des termes ici (fichier zip). Le graphique lui-même peut être téléchargé en format lisible par machine directement à partir du site viz.

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